Haruhi Fujioka, una estudiante becada, es confundida inmediatamente con un chico cuando llega a la escuela privada de élite Ouran Academy. Buscando un lugar tranquilo para estudiar, se topa con el Host Club y, en un intento de escapar, rompe accidentalmente un jarrón de ¥8 millones. Para pagar la deuda, Haruhi se hace miembro, necesitando que al menos cien clientes se lo "pidan" antes de poder irse. Sin embargo, uno por uno, los miembros del Host Club descubren su verdadero género; todos excepto Tamaki, quien accidentalmente la ve en ropa interior antes de entender la indirecta.