Shane, Tori y Dustin son tres estudiantes en la Wind Ninja Academy. Su rendimiento es inferior al del resto de estudiantes, y eso les gana muchas riñas de su sensei. Un día, Lothor, un maestro ninja expulsado, ataca la academia y captura a todos los estudiantes. Solo escapan Shane, Tori, Dustin, junto con el sensei y el hijo de este, Cam, quienes se retiran a la base de operaciones ninja bajo tierra. Allí, los tres estudiantes reciben los morphers que les permitirán transformarse en los Wind Rangers y proteger la cercana ciudad de Blue Harbor de las fuerzas de Lothor.