Trois groupes sont à la recherche de Conan, enlevé par une criminelle: Kogorō, Ran et Amuro d'un côté, la détective Sera Masumi de l'autre, ainsi que Haibara Ai, le professeur Agasa et Subaru dans une autre voiture. Le jeune détective est cependant plus conscient de sa situation qu'il n'en laisse paraître et, contre toute, attente, va enquêter avec sa ravisseuse.