Il dottor Hell costruisce Glossam X2, un nuovo mostro meccanico in grado di combattere sotto la superficie del mare, sfruttando un punto debole di Mazinger Z e Afrodite A. Il mostro meccanico attacca tutte le navi nell'Oceano Pacifico, tra cui anche la nave dove stanno viaggiando la figlia Lisa e la moglie del professor Gordon, in visita all'istituto per l'energia fotoatomica. Solo Lisa riesce a salvarsi grazie al sacrificio della madre e viene portata all'istituto da Koji e Sayaka. Gli scienziati iniziano a implementare in Mazinger Z le funzioni subacquee collaborando con il professor Gordon e sua figlia Lisa. Con l'effetto sorpresa, Koji mette fuori gioco Glossam X2 con il nuovo Mazinger Z.