Deze tweede film van Macross Frontier gaat verder waar de eerste ophield, Ranka's carrière floreert, terwijl de gezondheid van Sheryl's snel verslechtert nadat ze tijdens een live optreden instortte. Tegelijkertijd zijn afzonderlijke fracties achter de schermen aan het manoeuvreren om de Vajra horde te controleren door gebruikmaking van de zangtalenten van de twee zangeressen. Wanneer de gehele Macross Frontier vloot begint aan de laatste oorlog tegen de Vajra, maakt Alto eindelijke een keuze tussen Ranka en Sheryl.