De eerstejaarsstudent Yūshi Inaba moet op zoek naar een nieuwe plek om te wonen nadat zijn slaapzaal op de middelbare school is afgebrand. Omdat hij geen ouders heeft en onafhankelijk van zijn oom wil leven, vindt hij uiteindelijk een goedkoop appartement voor 25.000 yen genaamd Kotobuki-sō, maar ontdekt dat er menselijke en bovennatuurlijke wezens zoals geesten, yōkai en mononoke samenleven. Daar begint Yūshi's nieuwe dagelijkse leven.