为了让人类从支配中解放的圣日耳曼,带着巨大Alca-Noise袭来。因为装者的联合攻击,巨大Alca-Noise被击溃,但那却个陷阱。巨大Alca-Noise分裂成几个个体,各自开始侵略行动。为了完成LiNKER,为了寻找最后的碎片,即与Symphogear相连的大脑区域,观测残留的电气信号痕迹的玛利亚和艾尔芙娜茵,在昏暗世界的最深处被那个令人怀念又不爽的声音所愚弄。与数不尽的Alca-Noise陷入消耗战的装者们已精疲力尽。在危机逼近挚友·未来之际,响面临正义的抉择,正想去拔剑。另一方面,在假想形成的深层意识内,玛利亚客观地看待自己的记忆,比起童孩时代站在更高更宽的视角看清事实。那就是威尔博士经常所说的“爱”。LiNKER的配方终于完成,调、切歌、玛利亚出动支援响等人。