Alla Shibusen gira voce che Sid, uno degli insegnanti della scuola, sia morto e che ora voglia che anche gli studenti seguano la sua fine. Scampando alla lezione tenuta dal provvisorio professore Spirit, Maka, Soul, Black Star e Tsubaki vengono mandati dal Sommo Shinigami a seguire un corso di recupero al cimitero. I quattro studenti devono sconfiggere lo zombie di Sid e capire chi lo abbia ridotto così. Sconfittolo, scoprono che il responsabile è Franken Stein un maestro d'armi che in passato era stato un allievo della Shibusen. Così Maka e gli altri raggiungono la casa di Stein.