Dopo essere rimasto fermo a Eureka per via di un incidente, lo Sceriffo Federale Jack Carter e sua figlia Zoe si rendono conto che a Eureka sta succedendo qualcosa di strano. Il fenomeno causa la morte di uno degli abitanti e Carter decide di occuparsi delle indagini insieme all'Agente Allison Blake. Mentre sta raccogliendo indizi per cercare di capire cosa è successo, Carter fa la conoscenza degli eccentrici abitanti di Eureka.