In seguito all'ultimatum dei militari bajoriani, Deep Space Nine viene evacuata. Mentre i civili vengono imbarcati su navette e messi in salvo, Sisko e i suoi ufficiali decidono di rimanere nascosti sulla base per affrontare i ribelli. Nel frattempo Dax e Kira tentano di raggiungere la sede del governo su Bajor per dimostrare che dietro alla violenta rivolta si nascondono in realtà i Cardassiani...